同年9月，正是甘蔗成熟的季節，一些法律意識淡薄的村民乘機而上，糟蹋甘蔗，形成你偷我搶的不良現象。為及時有效制止這種不法行為，陳元棋主動請纓蹲點值班，為了份外的事廢寢忘食地工作著。一天子夜，他發現在通往蔗園的小路上，有2個人抬著偷來的甘蔗緩慢地走著，就立即上前阻止。豈料，其中一人乘機喊來了其他的同伙。無奈他只孤身一人，被歹徒用棒打、刀砍、磚砸，頭部多處受傷，雖然經過醫生的精心治療和護理，保住了生命，卻留下了終身的殘疾，落下了經常頭痛、暈厥的毛病。

雖然后來陳元棋因為傷情復發，而不得不離開自己鐘愛的保衛工作，但他并沒有停止自己見義勇為的步伐，依然懷著那份熱忱，在他人面對死神和災難威脅時挺身而出。

1999年12月21日傍晚，同村村民陳元來（復員軍人）一家外出勞作，家中卻因草木灰自燃，引發火災。在家煎藥的陳元棋看到村東上空濃煙滾滾，意識到是發生了火災，就立即喊上自己的妻子及孩子，帶上竹梯及水桶去救火。面對熊熊的烈火，陳元棋奮不顧身，一面呼喊鄉親們一起支援，一面沖進室內就近滅火。因煙霧熏眼，他誤跨燒透的木材堆上，導致下榻，經掙扎翻滾，帶著火苗撬門竄出，其頭發燒焦，手、腳及軀體部分也被烈火灼傷。但他不顧摔傷、燒傷，依舊不下火線，繼續帶領群眾救火。一直到烈火被撲滅，他才在妻子的攙扶下回家。由于燒灼傷，他經過了六星期的治療才得以康復。當他得知陳元來經火災燒了木料家財以至無力重建時，他又與妻子把自己欲建房的一些建筑材料無償運載到陳元來家，還出工掏錢幫助其恢復原貌，經過十余天的勞動，直至工程完善才回家。