連日來，泉州市衛生部門緊急動員起來，全面開展災后防病工作。

6月中旬以來，市衛生局召開3次專題會議，市愛衛會和市衛生局緊急下發通知，全面部署災后防病工作。

泉州市加強衛生應急物資儲備，及時購置有關物資，市本級已儲備漂白粉12噸、漂白精片500公斤、氯氰菊酯100公斤、敵敵畏100公斤、84消毒液500公斤。同時向安溪、德化縣各下撥1噸漂白粉，支援受災縣防疫工作。目前，市衛生局已緊急下撥20萬元衛生防災經費到7個受災較嚴重的縣（市、區）和市疾控中心。全市愛衛辦緊急動員開展衛生綜合整治，在有災情的鄉鎮（街道、社區）組織廣大群眾迅速清淤，清除垃圾、水漂物、動物尸體；對過水后的居住環境、被污染的水源進行消毒。

根據省衛生廳指令，6月26日下午，泉州市派出一支衛生防疫監督隊，攜帶30件價值近20萬元的消殺藥械、衛生監測儀器，前往南平順昌縣、延平區，支援災區災后防病工作。26日晚，防疫隊已抵達災區并立即投入工作。

全市衛生部門還組織印發4萬份災后防病知識宣傳材料，讓群眾掌握災后衛生防病知識，同時組織在泉州晚報、東南早報等媒體上進行災后防病專題報道。